Öncelikle fırçasız DC su pompasının yapısı fırçalı su pompasından farklıdır.Önemli olan yapının farklı olması, dolayısıyla ömrü, fiyatı ve kullanımında farklılıklar olacaktır.Fırçalı su pompasında kullanım sırasında yıpranacak karbon fırçalar bulunmaktadır, bu nedenle kullanım ömrü daha kısa ve fiyatı daha düşüktür.Fırçasız su pompasında karbon fırça yoktur, servis ömrü uzundur ve fiyatı nispeten yüksek olacaktır.

Sürüş modu açısından bakıldığında hem fırçasız su pompaları hem de fırçalı su pompaları elektrikli su pompaları olmasına rağmen fırçasız DC su pompaları fırçasız DC motorlarla, fırçalı su pompaları ise fırça motorlarıyla sürülür. Çalışma prensibi farklıdır.

Bu nedenle satın alma sürecinde kullanıcıların bu temel bilgileri anlaması ve doğru pompayı seçmesi gerekmektedir.